W trzeciej części nasz bohater ma przejąć koronę po królu Haroldzie. Shrek jednak nie chce brać na siebie tak wielkiej odpowiedzialności i odmawia. Tym samym Shrek, Osioł i Kot w butach muszą wyruszyć na poszukiwanie innego kandydata godnego tego zaszczytu. Jednym z pretendentów do tronu jest siostrzeniec królowej Lilian - młody i zbuntowany Król Artur. W tym czasie Fiona, córka króla Zasiedmiogórogrodu, żona Shreka, organizuje ruch oporu, który ma powstrzymać Księcia z bajki przeprowadzającego zamach stanu.